（一）負責建立健全生態環境基本制度。會同有關部門擬訂國家生態環境政策、規劃并組織實施，起草法律法規草案，制定部門規章。會同有關部門編制并監督實施重點區域、流域、海域、飲用水水源地生態環境規劃和水功能區劃，組織擬訂生態環境標準，制定生態環境基準和技術規范。
　　（二）負責重大生態環境問題的統籌協調和監督管理。牽頭協調重特大環境污染事故和生態破壞事件的調查處理，指導協調地方政府對重特大突發生態環境事件的應急、預警工作，牽頭指導實施生態環境損害賠償制度，協調解決有關跨區域環境污染糾紛，統籌協調國家重點區域、流域、海域生態環境保護工作。
　　（三）負責監督管理國家減排目標的落實。組織制定陸地和海洋各類污染物排放總量控制、排污許可證制度并監督實施，確定大氣、水、海洋等...