實施綜合許可，是指將一個企業(yè)或者排污單位的污染物排放許可在一個排污許可證集中規(guī)定，現(xiàn)階段主要包括大氣和水污染物。這一方面是為了更好地減輕企業(yè)負擔，減少行政審批數(shù)量；另一方面是避免為了單純降低某一類污染物排放而導致污染轉移。環(huán)保部門應當加大綜合協(xié)調，充分運用信息化手段，做好不同環(huán)境要素的綜合許可。

一證式管理既指大氣和水等要素的環(huán)境管理在一個許可證中綜合體現(xiàn)，也指大氣和水等污染物的達標排放、總量控制等各項環(huán)境管理要求；新增污染源環(huán)境影響評價各項要求以及其他企事業(yè)單位應當承擔的污染物排放的責任和義務均應當在許可證中規(guī)定，企業(yè)守法、部門執(zhí)法和社會公眾監(jiān)督也都應當以此為主要或者基本依據(jù)。